Tú eres el Prototipo, Alex Mercer, un hombre sin recuerdos armado con unas increíbles habilidades de transformación, debes abrirte camino hacia el centro de la conspiración responsable de tu creación y hacer pagar a los responsables.

- Combate con transformaciones Rápidas y Mortíferas: Reconfigura tu cuerpo para cada situación específica. Ya sean Garras, Hojas, Martillos o Látigos, escoge el arma adecuada para el momento. Cambia a un escudo o blindaje para la defensa, o utiliza avanzados poderes sensoriales (visión térmica, visión infectada) para localizar a tus enemigos.

- Habilidades unicas de Camuflaje: Consume a cualquiera, en cualquier momento, toma su apariencia, sus recuerdos y sus habilidades especiales.

- Compleja Trama de Conspiración: Despierta sin el más mínimo recuerdo del pasado...tan sólo unos misteriosos poderes y una conexión en un pueblo de Idaho. Investiga los misterios de tu origen, la auténtica naturaleza de tus poderes y tu parte en una conspiración.